Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM3A6NNA2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms