Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms