Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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