Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
YBX2Q9Y2T7 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms