Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC27A6Q9Y2P4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC27A6Q9Y2P4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms