Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms