Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFR3BQ9Y2G0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms