Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms