Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM5BQ9UGL1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms