Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLKQ9UBT6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms