Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms