Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms