Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms