Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATG3Q9NT62 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms