Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT82Q9NSB4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms