Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZCCHC17Q9NP64 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms