Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KIAA1549Q9HCM3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms