Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSDMCQ9BYG8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSDMCQ9BYG8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms