Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms