Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms