Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHP1Q99653 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHP1Q99653 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms