Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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