Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SPTSSAQ969W0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SPTSSAQ969W0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SPTSSAQ969W0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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