Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms