Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ATG4DQ86TL0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ATG4DQ86TL0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ATG4DQ86TL0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ATG4DQ86TL0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ATG4DQ86TL0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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ATG4DQ86TL0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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