Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms