Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms