Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRC8EQ6NSJ5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms