Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SAMD13Q5VXD3 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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SAMD13Q5VXD3 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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SAMD13Q5VXD3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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SAMD13Q5VXD3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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SAMD13Q5VXD3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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SAMD13Q5VXD3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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SAMD13Q5VXD3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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