Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms