Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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