Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FREM1Q5H8C1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FREM1Q5H8C1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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FREM1Q5H8C1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FREM1Q5H8C1 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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