Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SDK2Q58EX2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms