Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNDC1Q4ZHG4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNDC1Q4ZHG4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms