Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHKAPQ2M3C7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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