Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms