Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCK2Q16822 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms