Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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RTN1Q16799 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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RTN1Q16799 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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RTN1Q16799 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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RTN1Q16799 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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RTN1Q16799 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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