Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms