Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SGCBQ16585 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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