Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDSNQ15517 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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