Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms