Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHD4Q14839 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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