Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms