Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
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