Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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COL4A6Q14031 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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COL4A6Q14031 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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COL4A6Q14031 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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COL4A6Q14031 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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COL4A6Q14031 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL4A6Q14031 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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