Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMB3Q13751 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms