Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1A4Q13733 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1A4Q13733 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms