Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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TOP3AQ13472 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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TOP3AQ13472 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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TOP3AQ13472 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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