Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF6Q13247 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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